Setelah bertahun-tahun terlindungi dari dunia manusia, saudara kura-kura bertekad untuk memenangkan hati warga New York dan diterima sebagai remaja normal melalui tindakan heroik. Teman baru mereka, April O’Neil, membantu mereka menghadapi sindikat kejahatan misterius, tetapi mereka segera kewalahan saat pasukan mutan menyerang mereka.