Saat kru Enterprise dipanggil pulang, mereka mendapati kekuatan teror yang tak terhentikan dari dalam organisasi mereka sendiri telah meledakkan armada dan semua yang diperjuangkannya, meninggalkan dunia kita dalam keadaan krisis. Dengan dendam pribadi yang harus dilunasi, Kapten Kirk memimpin perburuan ke dunia zona perang untuk menangkap seorang pria yang memiliki senjata pemusnah massal. Saat para pahlawan kita didorong ke dalam permainan catur epik antara hidup dan mati, cinta akan ditantang, persahabatan akan hancur, dan pengorbanan harus dilakukan untuk satu-satunya keluarga yang tersisa bagi Kirk: krunya.