Setelah pembantaian kejam keluarganya oleh tentara bayaran sedingin batu Sub-Zero, Hanzo Hasashi diasingkan ke Netherrealm yang penuh siksaan. Di sana, sebagai imbalan atas pengabdiannya kepada Quan Chi yang jahat, ia diberi kesempatan untuk membalaskan dendam keluarganya – dan dibangkitkan sebagai Scorpion, jiwa yang hilang yang bertekad membalas dendam. Kembali ke Earthrealm, Lord Raiden mengumpulkan tim prajurit elit – biksu Shaolin Liu Kang, perwira pasukan khusus Sonya Blade dan bintang laga Johnny Cage – sekelompok pahlawan yang tidak mungkin dengan satu kesempatan untuk menyelamatkan umat manusia. Untuk melakukan ini, mereka harus mengalahkan gerombolan gladiator Outworld Shang Tsung dan menguasai turnamen Mortal Kombat.