Detektif cyborg Batou ditugaskan untuk menyelidiki serangkaian pembunuhan yang dilakukan oleh gynoids—cyborg seperti boneka, yang semuanya mengalami malfungsi, terbunuh, lalu menghancurkan diri sendiri setelahnya. Otak gynoids melakukan inisialisasi untuk melindungi perangkat lunak buatan pabriknya, tetapi dalam satu gynoids, yang dinetralkan Batou sendiri, satu berkas tetap ada: suara yang mengucapkan kalimat “tolong aku.”