Dari padang pasir Mesir hingga jauh di bawah lapisan es kutub, tim elit G.I. Joe menggunakan peralatan mata-mata dan militer generasi mendatang terkini untuk melawan pedagang senjata korup Destro dan ancaman yang berkembang dari organisasi Cobra yang misterius untuk mencegah mereka menjerumuskan dunia ke dalam kekacauan.