Dua saudara perempuan pindah ke pedesaan bersama ayah mereka agar bisa lebih dekat dengan ibu mereka yang dirawat di rumah sakit, dan menemukan pepohonan di sekitarnya dihuni oleh totoro, roh ajaib hutan. Ketika si bungsu melarikan diri dari rumah, sang kakak mencari bantuan dari roh-roh untuk menemukannya.